Ein weiteres Highlight in Neverwinter Nights stellt der Dungeon-Master da: Dieser ist immer optional, es muss niemand die Rolle des Dungeon-Master übernehmen. Das gesamte Spiel kann man natürlich auch ohne Dungeon-Master bestreiten.
Der Dungeon-Master hat die gleiche Funktion wie bei allen anderen Pen&Paper-Rollenspiel auch: Er kann das gesamte Spiel steuern und beeinflussen, oder seine eigens im Editor erstellte Welt kontrollieren. Ein paar Beispiele: Er kann Monster erschaffen und auf die Spieler in seiner Welt hetzen, er kann die Kreaturen selbst steuern, er kann den Spielern NPC's zur Hilfe schicken oder die Party einfach unverwundbar machen. Er kann die Spieler für erfolgreiche Kämpfe oder erfolgreich gelöste Rätsel belohnen, oder natürlich auch bestrafen.
Im Multiplayer können auch mehrere Spieler in die Rolle des Dungeon-Master schlüpfen. Dadurch entstehen völlig neue Möglichkeiten für die Spielleiter. So können sie beispielsweise Dialoge oder Kämpfe zwischen mehreren Wesen nachspielen und komplexe Ereignisse inszenieren. Natürlich kann der Dungeon-Master jederzeit Gegenstände in die Welt einbringen und vorher erstellte Ereignisse per Knopfdruck ablaufen lassen (z.B. ein Überfall auf die Party, Gespräche...).